薬剤師が不在でも一部の一般用医薬品の販売がOK
これが医薬品の登録販売者のざっくりとした考え方。
来年に第一回の試験が行われます。
http://www.mhlw.go.jp/shingi/2007/07/s0701-1.html

今後薬剤師の立場がどうなっていくかは想像できますか？

かなり逆風になると私は予想しています。

薬剤師の社会的なプレゼンスを示すこと。
これが喫緊の課題であると思います。